目的分析微生物检验对医院感染发生率及临床合理用药的影响。方法选取我院2018年1月—2019年12月收治的104例患者,随机分为观察组和对照组,每组52例。对照组常规给药,观察组行微生物检验,结合检验结果提供用药服务。对比两组医院感染发生率、临床用药合理性、住院期间平均花费、住院时间。结果观察组医院感染发生率较低,临床用药合理性、住院期间平均花费较高,住院时间较短。与对照组相比差异具有统计学意义(P<0.05)。结论微生物检验有助于降低患者医院感染发生率和住院时间,提升临床用药合理性,但增加了患者住院期间平均花费。